Микроорганизмдер коллекциясы 1976 жылы Қазақстан Республикасы Білім және ғылым министрлігінің Микробиология және вирусология институтында құрылған және Қазақстан Республикасындағы ең маңызды ғылыми коллекциялардың бірі болып табылады.
Коллекцияда әртүрлі табиғи және антропогендік көздерден бөлініп алынған бактериялардың, актиномицеттердің, ашытқылардың және жіп тәрізді саңырауқұлақтардың штамдары сақталған. Коллекцияға ғылыми және практикалық қызығушылық тудыратын типтік, анықтамалық, өнеркәсіптік және патенттелген штамдар кіреді.
Коллекция үнемі дамып келеді: сақталған дақылдар микроорганизмдер таксономиясының заманауи тәсілдеріне сәйкес жүйелі түрде қайта қаралады және коллекцияға жаңа штамдар, соның ішінде бұрын коллекцияда көрсетілмеген түрлер үнемі қосылып отырады.